دبیر شورای هماهنگبارزه با مواد مخدر استان گیلان، مدیرکل مدیریت بحران استانداری زنجان، فرماندار شهرستان طارم و بخشدار چورزق از جمله سوابق اجرایی علی باقری به شمار می رود.
گفتنی است، علی باقری پیش از این در تاریخ ۵ دی ماه ۱۴۰۳ با حکم هادی حق شناس، استاندار گیلان به عنوان سرپرست معاونت سیاسی، امنیتی و اجتماعی استانداری گیلان منصوب شده بود.